Ngày nhận bài: 19-05-2020
Ngày duyệt đăng: 02-06-2020
DOI:
Lượt xem
Download
Cách trích dẫn:
MỘT SỐ ĐẶC TÍNH SINH HỌC PHÂN TỬ CỦA CHỦNG PEDV (PORCINE EPIDEMIC DIARRHEA VIRUS) PHÂN LẬP Ở LỢN NUÔI TẠI HƯNG YÊN
,
Đặng Hữu Anh
1
,
Trương Hà Thái
1
,
Huỳnh Thị Mỹ Lệ
1
Từ khóa
Porcine Epidemic Diarrhea Virus, đặc tính sinh học phân tử, Việt Nam
Tóm tắt
Kể từ khi được phát hiện vào năm 2009, đến nay, PEDV lưu hành ở cả 3 miền Bắc, Trung và Nam và gây ra những thiệt hại không nhỏ cho ngành chăn nuôi ở Việt Nam. Để góp phần hạn chế thiệt hại do bệnh gây ra, việc chế tạo và sử dụng vacxin phù hợp chủng là cần thiết. Nhằm cung cấp thêm thông tin về đặc tính sinh học của PEDV gây bệnh ở Việt Nam, nghiên cứu này đã phân tích đặc tính sinh học phân tử gen mã hóa tiểu phần S1 của một chủng PEDV phân lập ở Hưng Yên năm 2017. Kết quả nghiên cứu cho biết chủng phân lập PEDV_HY2017 thuộc genogroup G2 của PEDV và có mức tương đồng với các chủng PEDV của Việt Nam là 90-91% (genogroup G1) 95,7-98,2% (genogroup G2). Chủng PEDV_HY2017 mang 2 vùng đột biến thêm - xóa ở đoạn gen mã hóa tiểu phần protein S1 và giống với các chủng PEDV genogroup G2 của Việt Nam.
Tài liệu tham khảo
Boniotti M.B., Papetti A., Lavazza A., Alborali G., Sozzi E., Chiapponi C., Faccini S., Bonilauri P., Cordioli P. & Marthaler D. (2016). Porcine Epidemic Diarrhea Virus and Discovery of a Recombinant Swine Enteric Coronavirus, Italy.Emerg Infect Dis.22(1): 83-7.
Carvajal A., Arguello H., Martinez-Lobo F.J., Costillas S., Miranda R., P G.D.N. & Rubio P.(2015). Porcine epidemic diarrhoea: new insights into an old disease, Porcine Health Manag.1(1): 12.
Chang S.H., BaeJ.L., KangT.J., KimJ., Chung G.H., Lim C.W., Laude H., Yang M.S. & Jang Y.S. (2002). Identification of the epitope region capable of inducing neutralizing antibodies against the porcine epidemic diarrhea virus. Mol Cells.14(2): 295-9.
Chen X., Yang J., Yu F., Ge J., Lin T. & Song T. (2012). Molecular characterization and phylogenetic analysis of porcine epidemic diarrhea virus (PEDV) samples from field cases in Fujian, China.Virus Genes.45(3): 499-507.
Chen F., Ku X., Li Z., Memon A.M., Ye S., Zhu Y., Zhou C., Yao L., Meng X. & He Q. (2016a). Genetic characteristics of porcine epidemic diarrhea virus in Chinese mainland, revealing genetic markers of classical and variant virulent parental/attenuated strains. Gene.588(1): 95-102.
Chen Q., ThomasJ.T., Gimenez-Lirola L.G., Hardham J.M., Gao Q., Gerber P.F., Opriessnig T., Zheng Y., Li G., Gauger P.C., Madson D.M., Magstadt D.R. & Zhang J. (2016b). Evaluation of serological cross-reactivity and cross-neutralization between the United States porcine epidemic diarrhea virus prototype and S-INDEL-variant strains.BMC Vet Res.12(1): 70.
Chung H.C., Nguyen V.G., Moon H.J., LeeJ.H., Park S.J., Lee G.E., Kim H.K., Noh Y.S., Lee C.H., Goede D. & Park B.K. (2015). Isolation of Porcine Epidemic Diarrhea Virus during outbreaks in South Korea, 2013-2014.Emerg Infect Dis.21(12): 2238-40.
Cruz D.J., Kim C.J. & Shin H.J. (2008). The GPRLQPY motif located at the carboxy-terminal of the spike protein induces antibodies that neutralize Porcine epidemic diarrhea virus.Virus Res.132(1-2): 192-6.
Diep N.V., Norimine J., Sueyoshi M., Lan N.T. & Yamaguchi R. (2017). Novel Porcine Epidemic Diarrhea Virus (PEDV) Variants with Large Deletions in the Spike (S) Gene Coexist with PEDV Strains Possessing an Intact S Gene in Domestic Pigs in Japan: A New Disease Situation.PLoS One.12(1): e0170126.
Diep N.V., Sueyoshi M., Izzati U., Fuke N., Teh A.P.P., Lan N.T. & Yamaguchi R. (2018). Appearance of US-like porcine epidemic diarrhoea virus (PEDV) strains before US outbreaks and genetic heterogeneity of PEDVs collected in Northern Vietnam during 2012-2015, Transbound Emerg Dis.65(1): e83-e93.
Do Tien Duy, Nguyen Tat Toan, Puranaveja S. & Thanawongnuwech R. (2011). Genetic characterization of porcine epidemic diarrhea virus (PEDV) isolates from southern Vietnam during 2009-2010 outbreaks.Thai Journal of Veterinary Medicine.41(1): 55-64.
Gao Y., Kou Q., Ge X., Zhou L., Guo X. & Yang H. (2013). Phylogenetic analysis of porcine epidemic diarrhea virus field strains prevailing recently in China. Arch Virol.158(3): 711-5.
Grasland B., Bigault L., Bernard C., Quenault H., Toulouse O., Fablet C., Rose N., Touzain F. & Blanchard Y. (2015). Complete genome sequence of a porcine epidemic diarrhea s gene indel strain isolated in france in december 2014.Genome Announc.3(3): e00535-15.
Hou Y., Lin C.M., Yokoyama M., Yount B.L., Marthaler D., Douglas A.L., Ghimire S., Qin Y., Baric R.S., SaifL.J. & Wang Q. (2017). Deletion of a 197-amino-acid region in the N-terminal domain of spike protein attenuates porcine epidemic diarrhea virus in piglets, J Virol.91(14): e00227-17.
Kumar S., Stecher G. & Tamura K. (2016). MEGA7: molecular evolutionary genetics analysis version 7.0 for bigger datasets.Mol Biol Evol. 33(7): 1870-4.
Le V.P., Le D.Q., Than D.D., Nguyen T.T., Nguyen B.H., Choi S.E. & An D.J. (2016). Genetic diversity of the spike gene of the porcine epidemic diarrhea virus collected from the central and northern Vietnam during 2013-2016, 19thFederation of Asian Veterinary Associations Congress. pp.113-117.
Lee C. (2015). Porcine epidemic diarrhea virus: An emerging and re-emerging epizootic swine virus.Virol J.12(1): 193.
Li C., Li W., Lucio De Esesarte E., Guo H., Van Den Elzen P., Aarts E., Van Den Born E., Rottier P.J. M. & Bosch B.J. (2017). Cell attachment domains of the porcine epidemic diarrhea virus spike protein are key targets of neutralizing antibodies.J Virol.91(12): e00273-17.
Marthaler D., Bruner L., Collins J. & Rossow K. (2014). Third strain of porcine epidemic diarrhea virus, United States.Emerg Infect Dis.20(12): 2162-3.
Nguyễn Tất Toàn & Đỗ Tiến Duy (2012). Đặc trưng kiểu gien của virus gây bệnh tiêu chảy cấp (PEDV) trên heo ở một số tỉnh miền Đông Nam Bộ, Tạp chí Khoa học Kĩ thuật Thú y. 19(7): 34-41.
Nguyễn Tất Toàn, Nguyễn Đình Quát, Trịnh Thị Thanh Huyền, Đỗ Tiến Duy, Trần Thị Dân, Nguyễn Thị Phước Ninh & Nguyễn Thị Thu Năm (2012). Phát hiện virus gây bệnh tiêu chảy cấp (PEDV) trên heo ở các tỉnh miền Đông Nam Bộ, Tạp chí Khoa học Kĩ thuật Thú y. 19(5): 23-28.
Nguyễn Trung Tiến, Vũ Thị Thu Hằng, Huỳnh Thị Mỹ Lệ, Nguyễn Bá Hiên & Lê Văn Phan (2015). Một số đặc điểm sinh học phân tử của virus gây ra dịch tiêu chảy cấp ở lợn (porcine epidemic diarrhea- PED) tại Quảng Trị, Thái Nguyên và Thái Bình tự năm 2013-2014. Tạp chí Khoa học và Phát triển.13(7): 1089-1100.
Oldham J. (1972). Letter to the editor. Pig Farming. p. 10.
Song D., Moon H. & Kang B. (2015). Porcine epidemic diarrhea: a review of current epidemiology and available vaccines, Clin Exp Vaccine Res. p.4.
Song D. & Park B. (2012). Porcine epidemic diarrhoea virus: a comprehensive review of molecular epidemiology, diagnosis, and vaccines.Virus Genes. p. 44.
Sun D.B., Feng L., Shi H.Y., Chen J.F., Liu S.W. & Chen H.Y. (2007). Spike protein region (aa 636-789) of porcine epidemic diarrhea virus is essential for induction of neutralizing antibodies.Acta Virol. p.51.
Theuns S., Conceicao-Neto N., Christiaens I., Zeller M., DesmaretsL.M., RoukaertsI.D., AcarD.D., Heylen E., Matthijnssens J. & Nauwynck H.J. (2015). Complete genome sequence of a porcine epidemic diarrhea virus from a novel outbreak in belgium, january 2015.Genome Announc.3(3): e00506-15.
Tian Y., Yu Z., Cheng K., Liu Y., Huang J., Xin Y., Li Y., Fan S., Wang T., Huang G., Feng N., Yang Z., Yang S., Gao Y. & Xia X. (2013). Molecular characterization and phylogenetic analysis of new variants of the porcine epidemic diarrhea virus in Gansu, China in 2012.Viruses.5(8): 1991-2004.
Vui D.T., Thanh T.L., Tung N., Srijangwad A., Tripipat T., Chuanasa T. & Nilubol D. (2015). Complete genome characterization of porcine epidemic diarrhea virus in Vietnam.Arch Virol.160(8): 1931-8.
Wang L., Byrum B. & Zhang Y. (2014). New variant of porcine epidemic diarrhea virus, United States.Emerg Infect Dis.20(5): 917-9.