Ngày nhận bài: 13-06-2017
Ngày duyệt đăng: 24-04-2017
DOI:
Lượt xem
Download
Cách trích dẫn:
BƯỚC ĐẦU XÁC ĐỊNH PORCINE DELTACORONAVIRUS (PDCoV) GÂY TIÊU CHẢY Ở LỢN NUÔI TẠI THÀNH PHỐ HÀ NỘI VÀ TỈNH THÁI BÌNH
Từ khóa
Porcine deltacoronavirus, tiêu chảy, lợn, RT-PCR
Tóm tắt
Trong nghiên cứu này,kỹ thuật RT-PCR và giải trình tự gen đã được sử dụng để xác định sự có mặt của porcine deltacoronavirus (PDCoV) trong 18 mẫu bệnh phẩm gồm phân và ruột của lợn mắc bệnh tiêu chảy thu thập được năm 2015 tại 4 trang trại lợn nuôi tại Hà Nội và Thái Bình. Kết quả chẩn đoán cho thấy 15/18 (83,33%)mẫu bệnh phẩm cho kết quả dương tính với PDCoV. Kết quả phân tích về trình tự nucleotide và trên cơ sở giải mã trình tự đoạn gen nucleocapsid của PDCoV cho thấychủng virus PDCoV/VN/TB1/2015 trong nghiên cứu này có mức độ tương đồng về trình tự nucleotide là 99% và amino acidlà 99,5% khi so sánh với chủng virus VN-1215 tham chiếu phân lập được cùng năm 2015 tại Đồng Nai. Kết quả phân tích về cây phả hệ cho thấy chủng virus PDCoV/VN/TB1/2015 thu thập được ở Thái Bình và chủng virus VN-1215 phân lập được ở Đồng Nai năm 2015 nằm trên cùng một nhánh trên cây phả hệ và gần gũi với các chủng PDCoVphân lập được tại Hồng Kông năm 2012 và Trung Quốc năm 2014.
Tài liệu tham khảo
Chan JF., To, KK., Tse H., Jin DY., Yuen KY (2013). Interspecies transmission and emergence of novel viruses: lessons from bats and birds. Trends Microbiol., 21: 544-555.
Chen F., Zhu Y., Wu M., Ku X., Yao L., He Q (2015). Full-Length Genome Characterization of Chinese Porcine Deltacoronavirus Strain CH/SXD1/2015. Genome Announc, 3.
Hu H., Jung K., Vlasova AN., Chepngeno J., Lu Z., Wang Q., Saif LJ (2015). Isolation and characterization of porcine deltacoronavirus from pigs with diarrhea in the United States. J Clin Microbiol, 53: 1537-1548.
Nguyễn Tất Toàn., Nguyễn Đình Quát, Trịnh Thị Thanh Huyền., Đỗ Tiến Duy, Trần Thị Dân, Nguyễn Thị Phước Ninh, Nguyễn Thị Thu Năm(2012). Phát hiện virut gây bệnh tiêu chảy cấp (PEDV) trên heo ở các tỉnh miền Đông Nam Bộ. Tạp chí Khoa học kỹ thuật thú y, 5: 23-28.
Lee S and Lee C (2014). Complete Genome Characterization of Korean Porcine Deltacoronavirus Strain KOR/KNU14-04/2014. Genome Announc, 2.
Saeng-Chuto K, Lorsirigool A, Temeeyasen G, Vui DT, Stott CJ, Madapong A, Tripipat T, Wegner M, Intrakamhaeng M, Chongcharoen W, Tantituvanont A, Kaewprommal P, Piriyapongsa J, Nilubol D(2017). Different lineage of porcine deltacoronavirus in Thailand, Vietnam and Lao PDR in 2015. Transbound Emerg Dis., 64(1): 3-10.
Wang L., Byrum B., Zhang Y (2014). Detection and genetic characterization of deltacoronavirus in pigs, Ohio, USA, 2014. Emerg Infect Dis, 20: 1227-1230.
Wang L., Hayes J., Sarver C., Byrum B., Zhang Y (2016). Porcine deltacoronavirus: histological lesions and genetic characterization. Arch Virol.161(1):171-175.
Woo PC., Lau SK., Lam CS., Lau CC., Tsang AK., Lau JH., Bai R., Teng JL., Tsang CC., Wang M., Zheng BJ., Chan KH., Yuen KY (2012). Discovery of seven novel Mammalian and avian coronaviruses in the genus deltacoronavirus supports bat coronaviruses as the gene source of alphacoronavirus and betacoronavirus and avian coronaviruses as the gene source of gammacoronavirus and deltacoronavirus. J Virol.,86: 3995-4008.