Ngày nhận bài: 13-06-2017 / Ngày duyệt đăng: 24-04-2017
Trong nghiên cứu này,kỹ thuật RT-PCR và giải trình tự gen đã được sử dụng để xác định sự có mặt của porcine deltacoronavirus (PDCoV) trong 18 mẫu bệnh phẩm gồm phân và ruột của lợn mắc bệnh tiêu chảy thu thập được năm 2015 tại 4 trang trại lợn nuôi tại Hà Nội và Thái Bình. Kết quả chẩn đoán cho thấy 15/18 (83,33%)mẫu bệnh phẩm cho kết quả dương tính với PDCoV. Kết quả phân tích về trình tự nucleotide và trên cơ sở giải mã trình tự đoạn gen nucleocapsid của PDCoV cho thấychủng virus PDCoV/VN/TB1/2015 trong nghiên cứu này có mức độ tương đồng về trình tự nucleotide là 99% và amino acidlà 99,5% khi so sánh với chủng virus VN-1215 tham chiếu phân lập được cùng năm 2015 tại Đồng Nai. Kết quả phân tích về cây phả hệ cho thấy chủng virus PDCoV/VN/TB1/2015 thu thập được ở Thái Bình và chủng virus VN-1215 phân lập được ở Đồng Nai năm 2015 nằm trên cùng một nhánh trên cây phả hệ và gần gũi với các chủng PDCoVphân lập được tại Hồng Kông năm 2012 và Trung Quốc năm 2014.
