Ngày nhận bài: 08-12-2012
Ngày duyệt đăng: 23-01-2013
DOI:
Lượt xem
Download
Cách trích dẫn:
NGHIÊN CỨU ĐA DẠNG DI TRUYỀN CÂY KHOAI MÔN – SỌ BẰNG CHỈ THỊ PHÂN TỬ DNA
Từ khóa
Chỉ thị phân tử DNA, chỉ thị SSR, chỉ thị RAPD, đa dạng di truyền, khoai môn - sọ
Tóm tắt
Nghiên cứu này được tiến hành tại phòng thí nghiệm Sinh học phân tử - Khoa Công nghệ sinh học, Trường Đại học Nông nghiệp Hà Nội với60 mẫu giống khoai môn - sọđược thu thập tạicác địa phương khác nhau, để đánh giá đa dạng di truyền các mẫu giống khoai môn - sọ với 2 loại chỉ thị DNA là RAPD và SSRs. Sản phẩm PCR của hai chỉ thị này được phân tích bằng phần mềm NTSYSpc 2.1 Kết quả 67 allenđược nhân lên đối với 5 chỉ thị RAPD, trong đó có 47 allenđa hình chiếm 70,1% và 20 allenđược nhân lên đối với 5 chỉ thị SSRs, trong đó có 9 allenđa hình chiếm 45%. 60 mẫu giống khoai môn - sọ được phân thành 12 nhóm với hệ số tương đồng là 0,8. Kết quả trong nghiên cứu này có thể sử dụng trong công tác bảo tồn cũng như lai chọn tạo giống khoai môn sọ mới.
Tài liệu tham khảo
Balestre M., R.G. Von Pinho, J.C. Souza and J.L. Lima, 2008. Comparosion of maize Comparison of maize similarity and dissimilarity genetic coefficients based on microsatellite markers, Genet. Mol. Res. 7 (3): 695-705
Cardle, L., Ramsay, L., Milbourne, D., Macaulay, M., Marshall, D., and Waugh, R. 2000. Computational and experimental characterization of physically clustered simple sequence repeats in plants. Genetics, 156: 847–854.
Emma S. Mace and Ian D. Godwin, 2002. Development and characterization of polymorphic microsatellite markers in taro (Colocasiaesculenta)
Kreike C.M., H.J. Van Eck, V. Lebot (2004), Genetic diversity of taro, Colocasia esculenta (L.) Schott, in Southeast Asia and the Pacific, Theor Appl. Genet, 109: 761-768
Lakhanpaul. S, K.C. Velayudhan and K.V. Bhat (2003). Analysis of genetic diversity in Indian taro [Colocasia esculenta (L.) Schott] using random amplified polymorphic DNA (RAPD) markers. Genetic Resourcesand Crop Evolution 50: 603 – 609 , 2003.
Li Maolin (2000), Analysis of correlation between ethnobotany and genetic diversity of taro in China using RAPD Assay. In Proceedings of Twelfth Sympodium of The International Society for tropical root crops ( ISTRC) in Tsukuba, Japan Sep., 10-16, 2000. Pp.103-104.
Nguyễn Thị Ngọc Huệ và Nguyễn Văn Viết, 2004. Tài nguyên di truyền khoai môn – sọ ở Việt Nam. NXB Nông nghiệp
Nguyen Thi Ngoc Hue, Nguyen Van Viet, Vu Linh Chi and M.S Prana, 2010. Taro germplasm collection in Vietnam. In The Global diversity of taro: Enthnobotany and conservation, p.60-68.
Ramanatha Rao. V, Danny Hunter, Pablo B. Eyzaguirre and Peter J. Matthews, 2010. Ethnobotany and global diversity of taro. In The Global diversity of taro: Enthnobotany and conservation, p1-5.
Sharma, K., A.K. Mishra and R.S. Misra, 2008. A simple and efficient method for extraction of genomic DNA from tropical tuber crops. Afr. J Biotechnol.,7(8): 1018-1022.